Rのパッケージ “sf” をインストールしようとすると、バイナリー版よりソース版のほうが新しかったので、コンパイルしてインストールしようとした。しかし、エラーのためにインストールできない。
RStudioで：
> install.packages("sf")
依存対象 (dependency) ‘wk’, ‘classInt’, ‘s2’, ‘units’ もインストールします
利用できるバイナリー版がありますがソース版は後者です:
binary source needs_compilation
sf 1.0-7 1.0-8 TRUE
パッケージのソースからインストールを行いますか? (コンパイルが必要です) (Yes/no/cancel) yes
URL 'https://cran.rstudio.com/bin/macosx/contrib/4.2/wk_0.6.0.tgz' を試しています
...略...
configure: CXX: clang++ -mmacosx-version-min=10.13 -std=gnu++11
checking for gdal-config... no
no
configure: error: gdal-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package ‘sf’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/library/sf’
Warning in install.packages :
パッケージ ‘sf’ のインストールは、ゼロでない終了値をもちました
ダウンロードされたパッケージは、以下にあります
‘/private/var/folders/19/_1vh1zln4nv6mht93knpn2m00000gn/T/RtmpMVnVVL/downloaded_packages’
エラーをみると、gdal-configというファイルが存在しないか実行できないらしい。
諦めてバイナリー版をインストールすれば、とりあえずはインストールの問題は解決する。しかし、アップデートでいちいちコンパイルするかを訊かれるのは煩わしいので、少し試してみる。
“rgdal” というパッケージがあるのでインストールを試すと、同じようなエラーになる。gdalというライブラリーに依存しているようだ。
...略... configure: rgdal: 1.5-32 checking for /usr/bin/svnversion... no configure: svn revision: 1176 checking for gdal-config... no no checking for gdal-config... no no configure: error: gdal-config not found or not executable. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/library/rgdal’ Warning in install.packages : パッケージ ‘rgdal’ のインストールは、ゼロでない終了値をもちました ダウンロードされたパッケージは、以下にあります ‘/private/var/folders/19/_1vh1zln4nv6mht93knpn2m00000gn/T/RtmpMVnVVL/downloaded_packages’
Homebrewにgdalがあったので、インストールしてみる。（Homebrewはインストール済み）
gdalは地理空間情報データフォーマットを変換するためのライブラリらしい。ターミナルで：
% brew install gdal
ふたたびRStudioで”sf”のインストールしてみると、完了した。
gdalのインストール、コンパイルしてのインストールは、どれも時間がかかる。バイナリー版をインストールしてしまうのがとりあえずは早い。
sfを使って日本地図を描いてみた。
