Clearingとは、顕微鏡観察のために標本を透明にする処理のこと。標本と屈折率の近い溶媒に標本を浸漬し、界面での光の散乱を低減させる。in situハイブリダイゼーションの場合、未反応の基質を溶かして染色のコントラストを高める効果もある。
グリセリン
Clearing効果は弱いが水性で扱いやすい。PBSなどで50〜100％弱にして用いる。浸透圧で収縮しないよう、数段階にわけて濃度を上げる。胚が沈むのを見計らって次の段階の液に移す。
Murray’s solution
ベンジルアルコール（benzyl alcohol）と安息香酸ベンジル（benzyl benzoate）の1:2混合液。卵黄の屈折率に近い屈折率（1.56）を持つためにclearing効果が強く、胚はほとんど透明になる。欠点は、NBT/BCIPの青い染色を少しずつ溶かすこと、プラスチックを侵すこと、揮発臭があること。水溶液中の胚を次のように置換する
- 100%メタノール 10分間×2
- Murray’s solutionに移す
テトラヒドロナフタレン（tetrahydronaphtalene）
Murray’s solutionと同等のclearing効果があるが、青い染色の融解は少ない。
水溶液中の胚を次のように置換する：
水溶液中の胚を次のように置換する：
- 100%メタノール 5分間
- イソプロパノール 10分間
- テトラヒドロナフタレン 10分間
青い染色をゆっくりと溶かすので、長期保存には向かない。いったんPCR用のミネラルオイルに移して保存しておき、観察時にテトラヒドロナフタレンに戻す